发现号坠毁在镜像宇宙，船员们发现自己被邪恶版联盟通缉，而那个世界的舰长正是本季已死的英雄。
第一季开篇，发现号在执行常规科学考察任务时遭遇量子裂缝，被抛入镜像宇宙。在这个宇宙里，人类帝国残暴统治所有种族，而发现号被视为叛军舰船。更令人震惊的是，追捕他们的帝国舰队指挥官正是本季第一集就壮烈牺牲的原舰长洛卡。洛卡在镜像宇宙活了下来，并且成为帝国刽子手。大副伯纳姆必须带领船员隐藏身份，寻找回到主宇宙的方法。过程中他们发现，两个宇宙的平衡正在崩溃，洛卡的疯狂行为背后隐藏着拯救主宇宙妻子（在主宇宙也已牺牲）的执念。本季最终集，发现号必须在摧毁帝国系统和修复宇宙裂缝之间做出抉择，而洛卡选择了自杀式牺牲，换来两个世界的暂时稳定。
平行宇宙设定虽不新鲜，但“英雄变反派”的角色弧光极具戏剧张力。特效质感维持系列高水准，虫洞穿梭镜头美轮美奂。剧集重点探讨了“同一个人在极端环境下的不同选择”，洛卡的双重塑造令人唏嘘。第一季收尾干净，为后续留下悬念。
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